Olá estou com o mesmo problema. Tentei fazer como você falou, mas não funcionou. Não sei se fiz algo errado, segue algumas tentativas que fiz:
root:/var/www/html# /var/www/html/novosga/ php bin/novosga reset
bash: /var/www/html/novosga/: Is a directory
root:/var/www/html# /var/www/html/novosga/ php bin/novosga.php reset
bash: /var/www/html/novosga/: Is a directory
root:/var/www/html# /var/www/html/novosga/bin/ php bin/novosga.php reset
bash: /var/www/html/novosga/bin/: Is a directory
root:/var/www/html# /var/www/html/novosga/bin/ php bin/novosga reset
bash: /var/www/html/novosga/bin/: Is a directory
root:/var/www/html# locate bin/novosga
/var/www/html/novosga/bin/novosga
/var/www/html/novosga/bin/novosga.php